۱- کارگروه فرهنگی اجتماعی
وظایف اصلی این کارگروه عبارتند از:
۱ـ ارتقای بینش فرهنگی و روحیه خودباوری، خلاقیت و مسئولیت‌پذیری با تکیه بر شناساندن فرهنگ و مواریث اسلامی و ایرانی
۲ـ اعتلا و تعمیق به معرفت و بصیرت دینی مبتنی بر آموزه‌های قرآنی و معارف اهل بیت (علیهم السلام) در همه سطوح دانشگاهی
۳ـ حاکم کردن بینش توحیدی در عرصه‌های زندگی فردی و اجتماعی دانشگاهیان
۴ـ تجلی استعداد‌ها و برانگیختن خلاقیت و شکوفایی علمی و فرهنگی
۵ـ اهتمام به تحقق جنبش نرم افزاری تولید علم به منظور ارتقاء سطح دانش و توسعه علم گرایی به عنوان گفتمان فرهنگی مسلط در دانشگاه‌ها
۶ـ صیانت از فرهنگ، تمدن و هویت اصیل اسلامی – ایرانی و ترویج آن در میان دانشگاهیان با هدف تقویت وحدت و هویت ملی

۷ـ حفظ و ترویج ارزش‌های انقلاب اسلامی و ارتقای بینش سیاسی- اجتماعی جامعه دانشگاهی با تکیه بر رهنمودهای امام خمینی (ره) و مقام معظم رهبری

۸ـ ارتقاء مهارت‌های زندگی اجتماعی دانشجویان و تسهیل روند جامعه پذیری آنان

۹ـ مطالعه و آسیب شناسی پدیده‌های فرهنگی- اجتماعی و تقویت پژوهش‌های نظری و کاربردی با بهره برداری از همه ظرفیت‌های دانشگاهی  

۲- کارگروه پژوهشی
به منظور ساماندهی پژوهش‌ها و تحقیقاتی که در سطح دانشگاه‌ در حال انجام است و با هدف جبران عقب ماندگی‌های ایجاد شده در علوم مرتبط با فناوری‌های پاسخگو به تهدیدات متصور جمهوری اسلامی ایران، می‌توان گروه‌های تخصصی فناوری‌های نو، فناوری‌های بدیع، فناوری‌های جاری و توسعه زیر ساخت‌های تحقیقاتی (آزمایشگاه‌های مرجع، تخصصی و...) به کارگیری و توسعه بانک‌های اطلاعاتی، هدایت و حمایت از انجمن‌ها و NGO‌ها، تولید نشریات و مکتوبات، اتخاذ سیاست‌ها و برنامه‌های آینده پژوهانه، توسعه خلاقیت و نوآوری با هدایت و حمایت از کانون‌های تفکر را پیشنهاد نمود.
۳- کارگروه آموزشی
وظیفه اصلی این کارگروه، سیاست گذاری و برنامه ریزی در حوزه تدوین و اجرای دوره‌های کوتاه مدت عمومی و تخصصی، دوره‌های بلند مدت، بازنگری دوره‌های جاری (متون، سرفصل‌ها و واحدها) و تطابق با نیازمندی‌های پدافند غیر عامل می‌باشد. به همین منظور ذیل این کارگروه می‌توان گروه‌های تخصصی علوم فنی و مهندسی، علوم انسانی، علوم پایه، علوم هنر، علوم کشاورزی و علوم هنر را پیش بینی نمود که در این راستا از تمام ظرفیت‌های ساختاری موجود دانشگاه نیز می‌توان بهره کافی را جست.
۴- کارگروه عمرانی
در این کارگروه‌ها با سیاست گذاری و برنامه ریزی و هماهنگی مناسب موجبات حفظ و صیانت از زیرساخت‌های حیاتی وحساس دانشگاه‌، خوابگاه‌ها و پژوهشکده‌ها فراهم گردیده و با اتخاذ تدابیر لازم توسعه‌های آتی زیر ساخت‌های مراکز ذکر شده بر اساس ملاحظات پدافند غیر عامل تحت مدیریت در خواهد آمد.
۵- کارگروه بین دستگاهی
۶- کارگروه کمیته‌های فناوری‌ها و تهدیدات نوین

در اين كارگروه موضوع جنگ سايبري و زمينه هاي تهديد زاي فضاي مجازي بررسي مي شود و براي آنها راه كار پيشنهاد مي گردد. همچنين با آموزش مداوم به كاربران نسبت به آگاه سازي آنها تلاش مي شود.